- 在合众地区旅行的小智、艾莉丝、天桐一行人，来到了被称为“大地之剑”的塔为中心发展的城市：艾茵多奥克。这里是由曾经繁荣一时的大地之民所建立的国度，但现在已经落殁。 小智等人为了参加收获祭对战大会来到艾茵多奥克，他们在这里遇到了能给予人或精灵宝可梦难以想象力量的梦幻精灵宝可梦比克提尼。大地之民的后裔－德雷多企图利用比克提尼…
- 王冠市是个水与绿茵、古街道与近代建筑完美调合的城市。为了观看正在这里举办的“神奇宝贝足篮世界杯”，小智一行人向王冠市前进，在旅途中，与正在寻找同伴的神奇宝贝索罗亚相遇，并一路结伴随行。就在此时，被称为索罗亚克的神奇宝贝竟然化身成为雷皇、炎帝、水君的模样，在王冠市的街道上大搞破坏。 就连相隔了20年再度回到这座城市的雪拉比…
- 持续旅行的小智一行人，来到了被雄厚自然的河川环绕的城镇米季纳。这个城镇里拥有数千年前的遗迹，小智等人在巨大的岩山上朝遗迹前进。突然，遗迹附近的湖刮起了水龙卷并向小智等人逼近，就在快被龙卷风卷入时，出现了一位女性。这位名叫希娜的女性，是遗迹的守护者，拥有与神奇宝贝心灵相通的能力。在希娜的邀请下，让小智他们使用时空仪来说明…
- 小智和同伴们被卷进了时空漩涡，等他们回过神来，发现来到了一个奇怪的地方。四周的建筑物都是倒着的，空中乌云密布。这时，冥王龙突然出现，并向具有特殊能力的非攻击性精灵雪米发起了攻击。小智他们正预备迎战，有人出言阻止了他们。这是一个名叫无限的学者。他告诉大家，这里是“逆向世界”，不成以随便触怒冥王龙。在无限的帮助下，小智他们…
