故事的主人公是喜欢魔法的高中生黑羽快斗，他的父亲是在8年前因变乱而死亡的大魔法师——黑羽盗一。某日，他在房间一栋隐秘门中发现传说中的怪盗基德的衣服，因而他打算会见基德。在那里，他遇到了父亲过去的同伴——寺井，并得知父亲就是怪盗基德，而且死因不是变乱死而是他杀。因而，快斗为查出杀害父亲的犯人，而自己成为了基德。

消失8年，如今突然重出江湖的神秘怪盗——怪盗基德，引起了喜爱魔术表演的高中生黑羽快斗的注意，因为他父亲——世界知名魔术师黑羽盗一也是8年前去世的。快斗在鬼使神差之下，进入到父亲的密室，发现其中存放着与怪盗基德如出一辙的服装。疑惑的快斗决定穿上基德服装，去今晚基德的预告现场去一探究竟……快斗发现以基德身份活动的人竟然是盗平…