超古代的地球曾经拥有相当高度的文明，但宇宙联盟奥可夫·马纳夫担心人类文明会破坏宇宙的和平，所以出动大军将人类文明彻底消灭。时至现代，地球上已经筑起了新的文明，但宇宙联盟的威胁亦再次出现。为了人类的未来，凭仗超古代文明而觉醒的12位星神战士，将担负起守护地球的重任。

今数亿年前的超古代,有着比现代社会更加发达的具有高度文明的人类,然而,极度繁荣的社会却遭到"宇宙聪明"的野蛮攻击。超古代人类及其文明也在转眼间灰飞烟灰……数亿年后的现代,堀品博士(考古科学家)一次有时的机会,从超古代遗留下来的"情报相传"装置--记忆水晶板中得知:人类遭受毁灭之前,超古代人就已经制造出具有人类最强…