讲述涅吉在魔法学园毕业，作为见习魔法使的修行而来到日本的麻帆良学园担任女子初中部2年A组的班主任，经历了第一季和第二季各种混乱事件后，涅吉和学生们迎来了最后一年的初中生活。新作的事件背景设置在漫画版中升上初三后、结束了修学旅行和学园祭以后，首要讲述的是学生们的暑假生活。这次等待着涅吉及31名少女的又是什么奇怪事件呢？

魔法老师——涅吉·史普林菲尔德站在教室的门口，上课铃已经响过了，隔着移门，还是可以听到教室里那还停不下来的窃窃私语，那是将要成为自己学生的31个生猛的初中女生。能不行够成为称职的老师呢？能不行够成为优异的魔法使呢？能不行够追上心中那个遥远的背影呢？

东京铁塔上，三个不相识的女孩在一道强光下，突然掉在半空中。名为古列夫的魔导师告诉女孩们说，只有成为魔法骑士拯救锡菲罗，她们才能回到原来的世界。锡菲罗是个是一个充满意志力的世界，“意志力”可突破一切的限制。锡菲罗的世界架于一个所谓“支柱”结构上，在支柱“艾美诺公主”祈祷下，世界一片祥和。她们在使命当中遇到了相当多的敌人和…

在英国某间魔法学校修行的首席毕业生奈基，目前还只是个10岁的少年。他的目标是成为“出色的魔法使”。魔法学校给奈基指定的结业课题是“去日本普通学校当老师”！因而，奈基在祖父的朋友的帮助下进入了麻帆良学园，担任起有着31名女生的中等部2年A组的老师。 按照魔法使世界的传说，在魔法使的身边都会有一个珍爱着他的勇敢战士存在。这种帮助…

魔法老师——涅吉·史普林菲尔德站在教室的门口，上课铃已经响过了，隔着移门，还是可以听到教室里那还停不下来的窃窃私语，那是将要成为自己学生的31个生猛的初中女生。能不行够成为称职的老师呢？能不行够成为优异的魔法使呢？能不行够追上心中那个遥远的背影呢？

人们以人类女性为参照制造了机械人偶,住在日本国的间宫小樽由于机缘巧合唤醒了三位带有少女回路的机械女神莱姆、樱桃和红莓,在他的关爱下,三位人偶的少女回路不竭成长,而小樽也逐渐了解到三人身上所带的少女回路的真正含义.