在太逐一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一路并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本…

在太逐一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一路并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本…

本片描述几个少年，在数码科幻世界里的冒险和奋战的过程。故事是以七个小孩漂流到数码世界为开端，太一等突然被放逐到一个同时存在山、川、冰、河、热带雨林的谜一样的岛屿，在此与一向在等待太逐一群人的七只幼年期的数码宝贝相遇。他们的旅程前方却充满着危机！接连不断而来的数码宝贝们的混战和数码世界之谜，以及阻碍着太一他们前进的恶敌！…